КУТИЈА ТАТА: ФУНКЦИЈЕ И ФУНКЦИЈЕ - БИОЛОГИЈА - 2025

Кутија ТАТА у ћелијској биологији, консензус ДНК секвенца која се налази у свим родах живих организама и широко конзервиран. Секвенца је 5'-ТАТААА-3 'и могу је пратити неки поновљени аденини.

Локација кутије је узводно (или узводно, како се често у литератури назива) од почетка транскрипције. Ово се налази у регији промотора гена, где ће се догодити повезаност са факторима транскрипције. Поред ових фактора, РНА полимераза ИИ често се везује за ТАТА оквир.

РНА полимераза ИИ. Извор: Фвасцонцеллос 21:15, 14. новембар 2007. (УТЦ)

Иако је оквир ТАТА главни редослед промотора, постоје гени којима недостаје.

карактеристике

За почетак синтезе РНА потребна је да се РНА полимераза везује за специфичне секвенце у ДНК, које се називају промоторима. ТАТА поље је консензусна секвенца промотора. Зове се Прибнов бок у прокариотима, а Голдберг-Хогнесс кутија у еукариотама.

Дакле, ТАТА кутија је очувана област у ДНК. Секвенцирањем бројних почетних региона за транскрипцију ДНК показало се да је консензусна секвенца, или уобичајена секвенца, (5ʾ) Т * А * ТААТ * (3ʾ). Положаји означени звездицом имају високу хомологност. Последњи Т остатак се увек налази у промоторима Е. цоли.

Локација поља ТАТА у прокариотима

По договору, базни парови који одговарају почетку синтезе молекула РНА добијају позитивне бројеве, а паровима база који претходе почетку РНА дају негативни бројеви. ТАТА кутија је у региону -10.

Код Е. цоли, промоторска регија се налази између положаја -70 и +30. У овом региону постоји други консензусни низ (5ʾ) Т * ТГ * АЦА (3ʾ) на положају -35. Исто тако, положаји означени звездицом имају високу хомологност.

Локација поља ТАТА у еукариотама

У еукариотама, промоторске регије имају сигналне елементе који се разликују за сваку од РНА полимераза. У Е. цоли једна РНА полимераза идентификује сигналне елементе у промоторској области.

Поред тога, промоторне регије су у еукариотама раширеније. Постоје различите секвенце, смештене у региону -30 и -100, које успостављају различите комбинације у различитим промоторима.

У еукариотама постоје бројни фактори транскрипције који ступају у интеракцију са промоторима. На пример, фактор ТФИИД се везује за секвенцу ТАТА. С друге стране, рибосомални РНА гени су структурирани у облику више гена, један за другим.

Варијације у консензусним секвенцама региона -10 и -35 мењају везивање РНА полимеразе у промоторском региону. Према томе, мутација једног базног пара узрокује смањење брзине везања РНА полимеразе на промоторску регију.

Карактеристике

Улога у транскрипцији

ТАТА оквир учествује у везивању и иницијацији транскрипције. У Е. цоли, РНА полимеразна холоенцим се састоји од пет α ₂ ββσ подјединица . Подјединица σ везује се за дволанчану ДНК и креће се у потрази за ТАТА пољем, што је сигнал који означава почетак гена.

Како се дешава транскрипција?

Σ подјединица РНА полимеразе има веома високу константу промоторне асоцијације (редоследом 10 ¹¹ ), што указује на високу специфичност препознавања између ње и Прибнов бок секвенције.

РНА полимераза се веже за промотор и формира затворени комплекс. Затим формира отворени комплекс који карактерише локални отвор 10 пара парова ДНК двоструке спирале. Ово отварање је олакшано јер је низ Прибнов кутија богат АТ.

Када се ДНК одвоји, формира се прва фосфодиестерска веза и продужава РНА. Σ подјединица се ослобађа и РНА полимераза напушта промотор. Остали молекули РНА полимеразе могу се везати за промотор и започети транскрипцију. На овај начин се ген може преписати више пута.

У квасцу се РНА полимераза ИИ састоји од 12 подјединица. Овај ензим покреће транскрипцију препознавањем две врсте консензусних секвенци на 5ʾ крају почетка транскрипције, наиме: ТАТА консензусна секвенца; ЦААТ консензусни редослед.

Фактори транскрипције

РНА полимерази ИИ су потребни протеини, звани фактори транскрипције ТФИИ, како би се формирао активни транскрипциони комплекс. Ови фактори су прилично очувани код свих еукариота.

Фактори транскрипције су молекули протеинске природе који се могу везати за молекулу ДНК и имају могућност повећања, смањења или отказивања производње одређеног гена. Овај догађај је пресудан за регулацију гена.

Формирање транскрипцијског комплекса почиње везањем ТБП протеина ("ТАТА-везујући протеин") на ТАТА поље. Заузврат, овај протеин веже ТФИИБ, који се такође везује за ДНК. ТБП-ТФИИБ комплекс везује се за други комплекс који се састоји од ТФИИФ и РНА полимеразе ИИ. На овај начин, ТФИИФ помаже РНА полимерази ИИ да се веже за промотор.

На крају, ТФИИЕ и ТФИИХ се удружују и стварају затворени комплекс. ТФИИХ је хеликаза и потиче одвајање двоструког ланца ДНК, процеса за који је потребан АТП. То се дешава у близини почетног места синтезе РНА. На овај начин се формира отворени комплекс.

Фактори транскрипције и карцином

П53 протеин је фактор транскрипције, такође познат као протеин супресор п53. То је производ доминантног онкогена. Ли-Фрауменијев синдром узрокован је једном копијом овог мутираног гена, што доводи до карцинома, леукемије и тумора.

Познато је да П53 инхибира транскрипцију неких гена и активира други. На пример, п53 спречава транскрипцију гена ТАТА промотором формирањем комплекса који се састоји од п53, других фактора транскрипције и ТАТА промотора. Стога, п53 држи раст ћелије под контролом.

Референце

1. Бохински, Р. 1991. Биохемија. Аддисон-Веслеи Ибероамерицана, Вилмингтон, Делаваре.
2. Лодисх, Х., Берк, А., Зипурски, СЛ, Матсудариа, П., Балтиморе, Д., Дарнелл, Ј. 2003. Целлулар анд Молецулар Биологи. Уредништво Медица Панамерицана, Буенос Аирес.
3. Пријатељ, С. 1994. П53: поглед на лутку иза представе у сенци. Наука 265: 334.
4. Девлин, ТМ 2000. Биохемија. Редакција Реверте, Барцелона.
5. Воет, Д., Воет, Ј. 2004. Биохемија. Јонх Вилеи анд Сонс, Нев Иорк.
6. Нелсон, ДЛ, Цок, ММ 2008. Лехнингер - Принципи биохемије. ВХ Фрееман, Нев Иорк.